中国汉族人群MHC遗传变异数据库建成
2016-05-24 11:47:00   来源:新华网
内容摘要
MHC即主要组织相容性复合体,在人类中又被称作HLA,也就是人类白细胞表面抗原,被称为人类的“主要抗原”。近日,由安徽医科大学、复旦大学与华大基因研究院共同开展的人类MHC区域全覆盖深度测序终于完成。

近日,由安徽医科大学、复旦大学与华大基因研究院共同开展的人类MHC区域全覆盖深度测序终于完成。该研究成功构建出迄今为止最完整的中国汉族人群MHC遗传变异数据库,并阐述了其在复杂疾病研究中的重要价值。

MHC,即主要组织相容性复合体,在人类中又被称作HLA,也就是人类白细胞表面抗原,包括一系列紧密连锁的基因座,与人类免疫系统功能密切相关,涉及肿瘤、自身免疫性、免疫缺陷性、过敏性、感染类和代谢性等几乎所有复杂疾病的发生、发展,被称为人类的“主要抗原”。

据了解,阐明MHC区域与疾病的关系一直是生命医学研究领域的热点和难点。近年来,欧洲人群利用已建立的5225例来自I型糖尿病联盟的MHC区域遗传变异参考图谱,开展了众多欧洲人群复杂疾病的MHC关联性研究。但因缺乏大样本量的中国人群MHC遗传变异参考图谱,目前国内利用精细定位策略来寻找MHC区域与中国人群复杂疾病相关致病性变异的研究极少。

该研究是首次对中国人群的MHC区域进行大规模样本深度测序。通过自主研发的MHC目标区域捕获芯片,对20635例人群样本的MHC目标区域进行高深度测序和分析,成功建立世界上最大样本量的中国汉族人群MHC全区域完整遗传变异数据库。通过对MHC区域准确的序列分析和基因分型,完整展示出中国人群MHC区域突变位点和HLA基因的多态性图谱,为开展中国人群复杂疾病与MHC区域的相关性研究奠定坚实基础。

据介绍,该研究以银屑病为案例,首次采用测序的方法对MHC区域遗传变异在中国汉族银屑病人群发病中的相关性进行了全面、系统的大样本研究,发现了多个新的银屑病易感基因和位点,同时揭示了中国人群特异的银屑病易感位点,进一步证明了基于完整测序构建的Han-MHC数据库在中国人群相关复杂疾病研究中的巨大应用价值。

项目负责人、安徽医科大学张学军教授表示,该成果将为深入研究MHC区域遗传多态性在中国人群复杂疾病发生、发展中的相关机制提供新的契机,特别是对中国正在进行的各种复杂疾病的精准医学研究将起到重要作用。

同时,该研究为进一步探索MHC区域遗传多态性在自身免疫性疾病、感染性疾病、肿瘤、过敏性疾病等所有与MHC相关的复杂疾病中的作用机制提供了一个完整的遗传变异比对图谱。此外,该研究发现的MHC区域遗传变异靶标,将为免疫相关疾病的预测、早期诊断、药物疗效和副作用观察,以及靶向治疗的精准医学研究提供重要的参考数据。(如需转载,请注明来源自科技世界网